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GeezerVison is showing www.rcsb.org — RCSB PDB - 2ZCH: Crystal structure of human prostate specific antigen complexed with an activating antibody
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Entity ID: 1 | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Molecule | Chains | Sequence Length | Organism | Details | Image |
| Prostate-specific antigen | A [auth P] | 237 | Homo sapiens | Mutation(s): 0 EC: 3.4.21.77 | ![]() |
UniProt & NIH Common Fund Data Resources | |||||
GTEx: ENSG00000142515 | |||||
Entity Groups | |||||
| Sequence Clusters | 30% Identity50% Identity70% Identity90% Identity95% Identity100% Identity | ||||
| UniProt Group | P07288 | ||||
Sequence AnnotationsExpand | |||||
Reference Sequence | |||||
Entity ID: 2 | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Molecule | Chains | Sequence Length | Organism | Details | Image |
| monoclonal antibody 8G8F5 Fab | B [auth L] | 215 | Mus musculus | Mutation(s): 0 | ![]() |
UniProt | |||||
Entity Groups | |||||
| Sequence Clusters | 30% Identity50% Identity70% Identity90% Identity95% Identity100% Identity | ||||
| UniProt Group | P01665 | ||||
Sequence AnnotationsExpand | |||||
Reference Sequence | |||||
Entity ID: 3 | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Molecule | Chains | Sequence Length | Organism | Details | Image |
| monoclonal antibody 8G8F5 Fab | C [auth H] | 229 | Mus musculus | Mutation(s): 0 | ![]() |
UniProt | |||||
Entity Groups | |||||
| Sequence Clusters | 30% Identity50% Identity70% Identity90% Identity95% Identity100% Identity | ||||
| UniProt Group | P01863 | ||||
Sequence AnnotationsExpand | |||||
Reference Sequence | |||||
| Ligands 3 Unique | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| ID | Chains | Name / Formula / InChI Key | 2D Diagram | 3D Interactions | |
| NDG Download:Ideal Coordinates CCD File | D [auth P], E [auth P] | 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose C8 H15 N O6 OVRNDRQMDRJTHS-PVFLNQBWSA-N | Interactions Interactions & Density | ||
| PO4 Download:Ideal Coordinates CCD File | G [auth H] | PHOSPHATE ION O4 P NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K | Interactions Interactions & Density | ||
| CL Download:Ideal Coordinates CCD File | F [auth P] | CHLORIDE ION Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M | Interactions Interactions & Density | ||
| Length ( Å ) | Angle ( ˚ ) |
|---|---|
| a = 87.36 | α = 90 |
| b = 87.36 | β = 90 |
| c = 236.332 | γ = 90 |
| Software Name | Purpose |
|---|---|
| REFMAC | refinement |
| HKL-2000 | data collection |
| MOSFLM | data reduction |
| PROCESS | data scaling |
| XFIT | data reduction |